Die Jugendfußballabteilung des VfB 09 Bodenheim gehört zu den größten im Kreis Mainz. Während im Großfeldbereich bei U19 und U17 eine Spielgemeinschaft auf Ebene der VG Bodenheim besteht, wird in der U15 mit dem 1. FC Nackenheim kooperiert. Die übrigen Altersklasse können eigenständig gebildet werden.